生化工程系开设有生物工程、高分子材料与工程两个本科专业和高分子材料智能制造技术一个专科专业。

现有专、兼职教师30多人，全部具有硕士或博士学位，其中副教授以上职称26人，现有在校生500余人。充分依托湖北工业大学的发酵工程教育部重点实验室、教育部开放式大跨度轻工清洁生产研究生创新中心、等多个教学研究平台，系部自有专业分析实验室和中试车间，及多个学科虚拟仿真实验室。

生物工程专业于2013年被确定为学院重点建设的特色专业，2014年被湖北省批准为“湖北省普通高等学校战略性新兴（支柱）产业人才培养计划专业”，2016年建成湖北省省级“大学生实习实践”基地：高分子材料与工程专业是我院首批招生的专业之一，在2018年的中国大学本科专业排行榜中，我院高分子材料与工程专业被评为三星级，位于湖北省同类院校的第一名。

生化工程系学风优良，考研录取率20%以上，长期位于学院第一，一次性就业成功率92%以上。积极倡导学生参加科技创新活动，鼓励学生参加教师的科研团队，在中国“互联网+”大学生创新创业大赛、湖北省“挑战杯”大学生课外学术科技作品竞赛等竞赛、“全国大学生生命科学竞赛”、“全国大学生化工设计竞赛”等众多创新创业及学科竞赛屡获大奖。其中多项研究成果申请了发明专利或实用新型专利并获得授权，大部分研究成果实现了产业转化。

生化工程系注重应用型人才培养，与黄鹤楼酒业有限公司、武汉新华扬生物股份有限公司、华润雪花啤酒（武汉）有限公司、武汉科瑞电气有限公司、湖南岳阳巴陵石化等多家行业骨干企业紧密合作、聘请多名企业高级管理人员为客座教授，参与专业人才培养方案的修订、专业课程开发和改革，为学生校外实习实训、课外科技活动、就业等方面提供了个性化指导。